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太平洋側気候で温暖、降雪も少ないが、旧井川村と旧水窪町は雪が多く豪雪地帯である。ケッペンの気候区分では大部分は温暖湿潤気候だが、富士山は最暖月の平均気温が6℃しかなく、ツンドラ気候となっている。
北部には富士山や赤石山脈といった3,000m級の山々がそびえ、ここからいくつか河川が流れている。東部は火山が多く、西部には台地が見られる。